一个时辰后，不花剌城城南大门缓缓打开，哲别率领一千骑兵冲了进去。成吉思汗率领四万骑兵在门口等候、观察。一刻钟后，有一名蒙古骑兵出来禀报说，城内无诈，我们已经控制住了城门，哲别元帅率军攻上城墙，请成吉思汗放心入城。
成吉思汗即率领蒙古骑兵入城。
怯失利汗正在城北大门城墙上带领士兵抵抗蒙古步兵进攻，这时侍卫来报，不好了怯失利汗！伊斯兰教长带着教徒打开城南大门，迎蒙古骑兵入城了。
怯失利汗大骂一声，这些该死的叛国贼！然后无奈的带领守城士兵向内堡撤退，和他一起撤退的除将近两万守城士兵外，还有一万多预备军以及他们的家眷。
成吉思汗率领蒙古大军顺利进入不花剌城，当他来到城内大清真寺时，不花剌城伊斯兰教长已经带着教徒跪在那里迎接了。
成吉思汗问该教长，不花剌城的最高长官是谁？
该教长说，是阿拉丁摩诃末苏丹任命的怯失利汗，但现在已不知所踪。
成吉思汗对铁木格说，快去寻找怯失利汗踪迹。
铁木格即率领哲别和速不台万人队进行全城搜捕。
成吉思汗看见这座大清真寺无比雄伟，就问，这个是不是不花剌城最高长官的官邸？
该教长说，这里是伊斯兰教最大的神真主的居所。
成吉思汗问，不花剌城官邸在何处？
该教长说，就在东边半里处。
这时博尔术率领蒙古步兵也赶到这里。
成吉思汗对博尔术说，你即刻率军去把不花剌城府库封了。
博尔术领命而去。
然后成吉思汗下马，在纳牙阿等大批侍卫的保护下，步行进入大清真寺。
进入该清真寺后，成吉思汗见里面的神职人员多达上千人，又听教长介绍说全城的神职人员多达两万人，轻蔑的说，一个国家如果供养如此多的神职人员，那国家还能富裕强大吗？
成吉思汗毫不客气的命令这些神职人员给蒙古骑兵饲养战马。自己则和士兵们在清真寺内休整。
蒙古骑兵从附近的商店抢来酒肉，在清真寺里喝酒吃肉，肆意踩踏经书和神器。又把城里歌姬抢来，强迫她们唱歌跳舞，为其助兴。